Optužnica protiv Radovana Karadžića
22. jul 2008.Usledila je i druga 16. novembra 1995. i odnosila se na zločin u Srebrenici. Bivša glavna tužiteljica Haškog tribunala Karla Del Ponte potpisala je u maju 2000. jedinstvenu optužnicu, u kojoj se Karadžic tereti za genocid, zločine protiv čovječnosti, kršenja zakona i običaja rata i teške povrede Ženevskih konvencija.
Progoni i teror Bošnjaka i bosanskih Hrvata
Na 24 strane optužnice navodi se da je Karadžic, zajedno sa Momčilom Krajišnikom i Biljanom Plavšić, činio teška krivična djela kako bi obezbedio kontrolu nad područjima Bosne i Hercegovine koja je proglasio "Republikom Srpskom". Da bi postigao taj cilj, preduzeo je progone i teror kako bi se sa područja proglašenim srpskim eliminisali Bošnjaci i bosanski Hrvati ili sveli na zanemarljiv broj.
Od kraja marta do 31. decembra 1992. godine kontinuirano je proganjano, deportovano, zatvarano u logore i masovno ubijano nesrpsko stanovništvo u takozvanoj Republici Srpskoj. Ta taktika održavanja nesnosnih životnih uslova za nesrbe nastavljena je do 30. novembra 1995, a kulminirala je pogubljenjem 8000 Bošnjaka u Srebrenici u julu te godine.
Zločini u 41 opštini BiH
U optužnici se detaljno navode zločini koji su počinjeni u 41 opštini Bosne i Hercegovine nad kojima su snage Republike Srpske nasilno preuzele kontrolu.
Ubistvo 48 muškaraca, žena i djece u Bijeljini 1. i 2. aprila 1992, 34 civila u selu Grapska kod Doboja i 60 mještana sela Jelec kod Foče mjesec dana kasnije, te stotinu osoba sela Velagići kod Ključa 1. juna iste godine, zatim hapšenje hiljada Bošnjaka i bosanskih Hrvata u logorima Luka u Brčkom, Manjača, Omarska, Trnopolje, Keraterm, Batković samo su neki od desetina zločina koji su pobrojani u optužnici.
Posebna tačka Srebrenica
Posebna tačka odnosi se na Srebrenicu. Masovne egzekucije i prisilno premještanje stanovništva srebreničke enklave između 11. i 18. jula 1995, prema optužnici, imali su za posljedicu praktičnu eliminaciju svakog prisustva Bošnjaka u tom području, čime je okončana kampanja "etničkog čišćenja" započeta još u aprilu 1992.
Svi ti zločini bili su dio rasprostranjenih i sistematskih napada na Bošnjake, bosanske Hrvate i druge nesrpske civile sa područja takozvane Republike Srpske, koje je planirao, naredio, organizovao i ostvario Radovan Karadžic, zaključuje se u optužnici Haškog tribunala.